武警北京总队编制与领导指挥体制历经多次调整，核心变化集中在组建拆分、合并升格、2018年武警领导指挥体制改革三个关键阶段。
1983年正式组建武警北京总队，隶属于武警部队与市局双重建制。
后续拆分：拆分为第一和第二总队。
第二总队归市局领导，承担首都治安执勤、处突、市内警卫，业务接受市局调度；第一总队侧重核心警卫任务，主要由武警总部管理。

1999年：一、二总队合并，重新组建武警北京市总队，延续军地双重领导模式，市局长继续兼任总队第一政委。

2008年，总队正式升格为正军级，仍实行两统一分体制（国务院、军委统一领导、统一管理，公安分级指挥）。

公安拥有执勤任务调用、安保勤务指挥权，可以提出任务需求、调度兵力执行安保、突发事件处置；
人事任免、兵员、军事训练、后勤装备、干部提拔全部归武警总部管理，公安无权干预部队内部建设，不能任免、裁撤部队编制。

自2018‑01‑01起，武警部队改为军委集中统一领导，实行军委‑武警部队‑部队领导指挥体制，不再列入地方序列。

取消局长兼任总队第一政委制度；地方公安不再拥有直接任务指挥权，改为任务需求协调机制：地方需要武警兵力支援，要按照法定程序申请调动，军地之间为协同关系； 部队人事、训练、后勤、编制全部由武警部队垂直管理，地方无权直接调动兵力。