郭勋祺将军是四川华阳县永兴乡（今属成都双流）人 。 1912年，郭勋祺参军，跟随尹昌衡入西藏。1915年投奔川军潘文华部，后历任排长、连长等职。

1921年，郭勋祺随潘文华投靠刘湘，任33师65旅长。1922年，经陈孟熙介绍结识陈毅，后因与共产党关系密切，1925年被免去旅长职务。

1931年，郭勋祺复任旅长，前往湖北“围剿”洪湖革命根据地。1935年，他率军入贵州“围剿”中央红军，在青杠坡与红军激战两昼夜。同年11月，又奉命在四川天全、芦山一带阻击红四方面军。

1937年，郭勋祺率部出川抗战，参加南京保卫战，在夹浦与日军激战三昼夜，左腿负伤。
1938年，伤愈后升任50军军长，驻防皖南，多次与日军作战，还派部攻芜湖，牵制日军支援台儿庄。因与新四军合作密切，1941年被蒋免去职务。

1948年，担任第十五绥靖区副司令，在襄樊战役中被解放军俘获。后接受刘帅等人意见，返回四川执行统战工作，策反多名高级军官，促成成都和平解放。

解放后，历任川西行政公署委员兼交通厅长、省水利厅长等职务。选为第一届省人大代表。1959年12月28日，郭勋祺在成都市病逝。