单论理科实力，中国科学技术大学应该算是全国最佳。从软科公布的理科门类顶尖学科数量来看，中科大达到了七个，与北京大学并列第一。排在第三位的则是南京大学，其理科顶尖学科数量为五个，虽然与中科大和北大有所差距，不过却在清华大学（4个）之上，这样的成绩也极为难得。复旦大学也是理科顶尖高校，其顶尖学科数量与清华相同，并列全国第四。排名靠前的高校中，最令人意外的当属厦门大学。厦大财经类学科实力全国顶尖，不想理科顶尖学科数量也高达三个，与上海交通大学并列全国第六，甚至高于浙江大学，这对于整体实力在985高校中并不突出的厦大来说确实令人眼前一亮，其综合实力或许有被低估的嫌疑。
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