核心方面：阿拉伯民族主义与犹太复国主义的生存权冲突：自1948年以色列建国起，伊拉克便作为阿拉伯世界主力参加了历次中东战争，长期为巴勒斯坦解放提供支持，并将与以色列关系正常化视为“犯罪”。两国至今未建立外交关系，且从未达成停战协议。
安全方面：生死存亡的“核博弈”与领土完整威胁：这是最直接的冲突点。1981年以色列发动“巴比伦行动”，空袭摧毁伊拉克核反应堆，以绝后患。近年来，以色列被指公开支持伊拉克库尔德人独立公投，直接触碰伊领土主权红线。
现实方面：伊朗角力下的“第三方战场”：2003年伊拉克战争后，伊朗影响力大增。以色列为打击伊朗，常将伊拉克用作“跳板”：不仅被指在伊库尔德地区设有摩萨德据点，近期更被曝在伊沙漠秘密设立军事基地以支援对伊朗的空袭。这使得伊拉克领土频遭伊朗系武装与以色列的相互打击，深陷代理人战争漩涡。
可以看出，伊拉克与以色列的矛盾虽根植于历史，但如今已深度捆绑在“反美主义”、“地区霸权（伊朗）”和“国内教派政治”的现实博弈中，短期内很难化解。