武警第二机动总队为正军级单位，级别高于普通内卫总队。是武警总部机动作战力量、国家级战略应急力量。第一机动总负责北方，第二机动总队负责南方。形成南北双拳的布局。

武警第二机动总队共下辖16个副师级支队。其中机动支队9个，特战支队2个交通支队3个，直升机支队1个，工兵防化支队1个，

2017年底调整组建，从2018年1月1日按新体制运行；归军事委会集中统一领导，实行军委会—武警总部—部队指挥体制。下辖支队分散驻防南方多省。
编制编成总队—支队—大队—中队四级；含机动、特战（含雪豹突击队）、交通、直升机、工兵防化等多类支队，合成化、模块化编成。
反恐处突、防暴维稳
抢险救援、跨区增援
重大活动安保、海上反恐与维权
防卫作战与应急机动
能力特点：
全域快速投送：依托交通枢纽，3小时覆盖东南沿海、8小时覆盖华南华东。
装备精良：装甲车、重火力、直-20直升机、无人机、核生化防护等。
全域作战：适配山地、城市、沿海、高原等复杂环境。
主要负责华南、东南、西南全域。覆盖苏浙沪闽赣粤桂湘川渝黔滇藏等十余省市区。
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