哺乳动物的主要“生物钟”位于被称为视交叉上核（suprachiasmaticnucleus，简称SCN）的大脑部位。
控制生物钟的基因在脑部的视交叉上核的细胞内最为活跃。
大脑丘脑下部的下丘脑视交叉上核或生物钟保持身体随着24小时的节奏运转。
褪黑激素受体结合，发挥了阻碍在视交叉上核神经元的放电频率在睡眠过程中的作用。
研究表明生物钟位于下丘脑（一个腺体）的视交叉上核上。
更重要的是，这些区域包括掌管生物钟的视交叉上核。
生物钟被认为是叫做视交叉上核的神经细胞的聚集。
在哺乳动物中，主生物钟位于下丘脑视交叉上核的前下丘脑。
它传递有关光和黑暗的电波信息，信息由来自SCN叫做suprachiasmatic核心（SCN）视丘脑下部区域产生。
松果体和视交叉上核对大鼠体温昼夜节律的调节机制。